สวยงาม

"การสร้างจีโนมเป็นสิ่งสำคัญมาก" ดร. ทาเคชิ ทาเคอุจิ หนึ่งในสองผู้เขียนคนแรก นักวิทยาศาสตร์ประจำหน่วยจีโนมิกส์ทางทะเลของ OIST กล่าวว่า "การสร้างจีโนมเป็นสิ่งสำคัญมาก "จีโนมเป็นชุดที่สมบูรณ์ของยีนของสิ่งมีชีวิต ซึ่งหลายยีนมีความจำเป็นต่อการอยู่รอด ด้วยลำดับยีนที่สมบูรณ์ เราสามารถทำการทดลองมากมายและตอบคำถามเกี่ยวกับภูมิคุ้มกันและการก่อตัวของไข่มุกได้อย่างไร" ในปี 2012 ดร. ทาเคอุจิและผู้ร่วมงานของเขาได้ตีพิมพ์จีโนมแบบร่างของหอยมุกญี่ปุ่นPinctada fucataซึ่งเป็นหนึ่งในจีโนมแรกที่ประกอบขึ้นจากหอย พวกเขายังคงจัดลำดับจีโนมต่อไปเพื่อสร้างการประกอบจีโนมระดับโครโมโซมที่มีคุณภาพสูงขึ้น ดร. ทาเคอุจิอธิบายต่อไปว่าจีโนมของหอยนางรมประกอบด้วยโครโมโซม 14 คู่ ซึ่งสืบทอดมาจากพ่อแม่แต่ละคน โครโมโซม 2 แท่งของแต่ละคู่มียีนเกือบเหมือนกัน แต่อาจมีความแตกต่างกันเล็กน้อยหากยีนที่หลากหลายเป็นประโยชน์ต่อการอยู่รอดของโครโมโซม ตามเนื้อผ้า เมื่อมีการจัดลำดับจีโนม นักวิจัยจะรวมโครโมโซมคู่เข้าด้วยกัน วิธีนี้ใช้ได้ดีกับสัตว์ทดลองซึ่งโดยปกติจะมีข้อมูลทางพันธุกรรมเกือบเหมือนกันระหว่างโครโมโซมคู่หนึ่ง แต่สำหรับสัตว์ป่าซึ่งมียีนที่แปรผันจำนวนมากระหว่างคู่โครโมโซม สวยงาม วิธีนี้นำไปสู่การสูญเสียข้อมูล ในการศึกษานี้ นักวิจัยตัดสินใจที่จะไม่รวมโครโมโซมเมื่อจัดลำดับจีโนม พวกเขาจัดลำดับโครโมโซมทั้งสองชุดแทน ซึ่งเป็นวิธีการที่ไม่ธรรมดา อันที่จริง อาจเป็นงานวิจัยชิ้นแรกที่มุ่งเน้นไปที่สัตว์ไม่มีกระดูกสันหลังในทะเลที่ใช้วิธีนี้ เนื่องจากหอยมุกมีโครโมโซม 14 คู่ จึงมีทั้งหมด 28 คู่ นักวิจัยของ OIST Mr. Manabu Fujie และ Ms. Mayumi Kawamitsu ใช้เทคโนโลยีล้ำสมัยเพื่อจัดลำดับจีโนม ผู้เขียนคนแรกอีกคนคือ Dr. Yoshihiko Suzuki อดีตนักวิชาการหลังปริญญาเอกใน OIST's Algorithms for Ecological and Evolutionary Genomics และตอนนี้อยู่ที่มหาวิทยาลัยโตเกียว และ Dr. Takeuchi ได้สร้างโครโมโซมทั้ง 28 แท่งขึ้นใหม่ และพบความแตกต่างที่สำคัญระหว่างโครโมโซมทั้งสองของคู่เดียว -- โครโมโซมคู่ที่ 9 โดยเฉพาะอย่างยิ่งยีนเหล่านี้จำนวนมากเกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกัน ดร. ทาเคอุจิกล่าวว่า "ยีนที่แตกต่างกันในโครโมโซมคู่หนึ่งเป็นการค้นพบที่สำคัญ เนื่องจากโปรตีนสามารถจำแนกโรคติดเชื้อประเภทต่างๆ ได้" ดร. ทาเคอุจิกล่าว เขาชี้ให้เห็นว่าเมื่อสัตว์ได้รับการเพาะเลี้ยง มักจะมีสายพันธุ์ที่มีอัตราการรอดชีวิตสูงกว่าหรือผลิตไข่มุกที่สวยงามกว่า เกษตรกรมักจะผสมพันธุ์สัตว์สองตัวที่มีสายพันธุ์นี้ แต่นั่นนำไปสู่การผสมพันธุ์และลดความหลากหลายทางพันธุกรรม นักวิจัยพบว่าหลังจากผสมพันธุ์ติดต่อกัน 3 รอบ ความหลากหลายทางพันธุกรรมก็ลดลงอย่างเห็นได้ชัด หากความหลากหลายที่ลดลงนี้เกิดขึ้นในบริเวณโครโมโซมที่มียีนที่เกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกัน อาจส่งผลต่อภูมิคุ้มกันของสัตว์ได้ ดร. ทาเคอุจิ สรุป "การรักษาความหลากหลายจีโนมในประชากรสัตว์น้ำเป็นสิ่งสำคัญ งานวิจัยนี้ได้รับการสนับสนุนโดยทุนสนับสนุนจาก Project of the Bio-oriented Technology Research Advancement Institution ซึ่งเป็นโครงการพิเศษเกี่ยวกับการวิจัยและพัฒนาขั้นสูงสำหรับเทคโนโลยีรุ่นต่อไป ความคิดเห็นโดย Prof. Shugo Watabe (ศาสตราจารย์รับเชิญที่มหาวิทยาลัย Kitasato ศาสตราจารย์เกียรติคุณที่มหาวิทยาลัยโตเกียว)